Tag: PostgreSQL

PostgreSQL Docker-Compose Setup

Post author By Ingo
Post date 2021-December-22
1 Comment on PostgreSQL Docker-Compose Setup

Im vorletzten Post: PostgreSQL hatte ich beschrieben, wie ich zwei Bestandsdatenbanken analysiert und in eine PostgreSQL-DB in einem Docker Container gebracht habe, samt PGAdmin.

Jetzt möchte ich einen Schritt weiter gehen und das komplette Setup über ein Script starten können: DB, PGAdmin & SQL-Scripte. Dazu verwende ich Docker-Compose.

Ausgangslage

In PostgreSQL hatte ich bereits die zugrundeliegenden Docker-Images ermittelt: postgres:13.4-buster für die DB und dpage/pgadmin4 für PGAdmin. Inzwischen gibt es aber ein aktuelleres Image für die DB, das ich verwenden werde: postgres:13.5-bullseye

docker pull postgres:13.5-bullseye
docker pull dpage/pgadmin4

Für die SQL-Daten werde ich auf den Artikel PostgreSQL IDs zurückgreifen und daraus zwei Scripte machen, eines für das Schema der DB und eines mit den "Masterdaten" mit denen das Schema initial befüllt werden soll.

CREATE SEQUENCE object_id_seq
    START WITH 1
    INCREMENT BY 1
    NO MINVALUE
    NO MAXVALUE
    CACHE 1;

CREATE TABLE person (
    object_id integer NOT NULL DEFAULT nextval('object_id_seq'::regclass),
    vorname varchar(255),
    nachname varchar(255),
    CONSTRAINT person_pkey PRIMARY KEY (object_id)
);

CREATE TABLE adresse (
    object_id integer NOT NULL DEFAULT nextval('object_id_seq'::regclass),
    strasse varchar(255),
    ort varchar(255),
    CONSTRAINT adresse_pkey PRIMARY KEY (object_id)
);

INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Max', 'Mustermann');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Peter', 'Person');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Donald', 'Demo');

INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Beispielstrasse', 'Beispielstadt');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Erpelweg', 'Entenhausen');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Bruchstrasse', 'Berlin');

Auf der Seite von Docker Compose bringe ich in Erfahrung, dass die aktuelle Version von Docker Compose 3.9 ist und erstelle schon mal die Datei:

version: "3.9"  # optional since v1.27.0

Ordernstrucktur:

Images starten

Bisher habe ich PostgreSQL und PGAdmin über folgende Kommandos gestartet:

docker run --name myapp-db -p 5432:5432 -e POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD -d postgres:13.4-buster

docker run --name myapp-pgadmin -p 80:80 -e PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com -e PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin -d dpage/pgadmin4

Diese Kommandos werden in ein Docker-Compose Script transferiert:

version: "3.9"  # optional since v1.27.0
services:
  myapp-db:
    image: postgres:13.5-bullseye
    ports:
      - "5432:5432"
    environment:
      - POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD
  myapp-pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    ports:
      - "80:80"
    environment:
      - PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com
      - PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin

Jetzt können beide Images mit einem einfachen Befehl gestartet werden:

\myapp> docker-compose up
Creating network "myapp_default" with the default driver
Creating myapp_myapp-db_1      ... done
Creating myapp_myapp-pgadmin_1 ... done
Attaching to myapp_myapp-db_1, myapp_myapp-pgadmin_1

PGAdmin im Browser starten: http://localhost:80
Login wie bisher mit admin@admin.com / admin

Im nächsten Schritt gibt es bereits eine entscheidende Änderung:
Während bisher beide Container isoliert nebeneinander liefen und nur über den Host-Rechner kommunizieren konnten, wurde durch Docker-Compose automatisch beim Start ein Netzwerk ("myapp_default") angelegt, in dem beide Container laufen. Außerdem sind beide Container über ihren Servicenamen ("myapp-db" & "myapp-pgadmin") erreichbar.

Dadurch muss nicht mehr die IP des Host-Rechners ermittelt werden (die sich manchmal ändert), sondern es kann der Name genommen werden:

Datenbank erstellen

In der PostgreSQL Instanz muss jetzt eine Datenbank erzeugt werden, in der die Anwendungsdaten gespeichert werden.

Hierzu gehen wir in den DB Container.
Allerdings ist der Name anders als bisher: Es wurde der Verzeichnisname als Präfix davor und eine 1 (für die 1. und in unserem Fall einzige Instanz) als Postfix dahinter gehangen und so lautet der Name : myapp_myapp-db_1

docker exec -it myapp_myapp-db_1 bash

Im Container erzeugen wir die DB:

su postgres
createdb myappdb
exit

So war es zumindest bisher, einfacher geht es mit Docker-Compose und dem Setzten der Environment-Variablen POSTGRES_DB wodurch die DB automatisch angelegt und verwendet wird.
Sicherlich hätte ich das auch bisher im Docker Kommando so nehmen können, aber im letzten Post hatte ich es zum einen mit zwei DBs zu tun und zum anderen musste ich eh auf die Kommandozeile um die DBs einzuspielen.

version: "3.9"
services:
  myapp-db:
    image: postgres:13.5-bullseye
    ports:
      - "5432:5432"
    environment:
      - POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD
      - POSTGRES_DB=myappdb
  myapp-pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    ports:
      - "80:80"
    environment:
      - PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com
      - PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin

Datenbank befüllen

Bisher war der Weg, die SQL-Dateien in den Container zu kopieren und von dort einzuspielen:

# Dateien in Container kopieren
docker cp database/Masterdata.sql myapp_myapp-db_1:/tmp
docker cp database/Schema.sql myapp_myapp-db_1:/tmp
# In Container wechseln
docker exec -it myapp_myapp-db_1 bash

Im Container SQLs einspielen:

su postgres
psql myappdb < /tmp/Schema.sql
psql myappdb < /tmp/Masterdata.sql
exit

Einfacher geht es über Docker-Compose und den Mechanismus, dass PostgreSQL automatisch die Dateien importiert, die im Verzeichnis /docker-entrypoint-initdb.d/ liegen. Und zwar in alphabetischer Reihenfolge.

version: "3.9"
services:
  myapp-db:
    image: postgres:13.5-bullseye
    ports:
      - "5432:5432"
    environment:
      - POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD
      - POSTGRES_DB=myappdb
    volumes:
      - ./database/Schema.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/1-Schema.sql
      - ./database/Masterdata.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/2-Masterdata.sql
  myapp-pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    ports:
      - "80:80"
    environment:
      - PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com
      - PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin

PGAdmin Einstellungen persistieren

Während der Entwicklung öfters mal die DB platt macht und komplett neu aufsetzt: Mit Docker ist das schnell gemacht. Mit Docker-Compose sind es jetzt nur noch zwei Befehle:

# stop and remove stopped containers
docker-compose down
# start containers
docker-compose up

Einen Nachteil gibt es allerdings: Die Einstellungen im PGAdmin gehen ebenfalls flöten und müssen neu eingegeben werden.
Die Lösung: Der PGAdmin Container bekommt ein persistentes Volume, das ein docker-compose down übersteht. Und wenn es doch mal neu aufgesetzt werden muss, ist das einfach über das -v Flag umsetzbar: docker-compose down -v

version: "3.9"
services:
  myapp-db:
    image: postgres:13.5-bullseye
    ports:
      - "5432:5432"
    environment:
      - POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD
      - POSTGRES_DB=myappdb
    volumes:
      - ./database/Schema.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/1-Schema.sql
      - ./database/Masterdata.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/2-Masterdata.sql
  myapp-pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    ports:
      - "80:80"
    environment:
      - PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com
      - PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin
    volumes:
      - pgadminvolume:/var/lib/pgadmin
volumes:
  pgadminvolume: {}

DB Image mit Schema und Masterdata

An Schema und Stammdaten wird sich erstmal nichts ändern. Daher wäre es gut, wenn beim Neubau der Container die DB bereits mit Schema und Stammdaten gestartet wird und nicht diese erst aufbauen muss.

Das wird dadurch erreicht, dass ein Image gebaut wird, dass die PostgreSQL DB sowie Schema und Stammdaten enthält.

Im Verzeichnis database wird eine Datei Dockerfile angelegt. Dieses Dockerfile enthält die Informationen zum Bau des DB Images.

FROM postgres:13.5-bullseye
 ENV POSTGRES_PASSWORD PASSWORD
 ENV POSTGRES_DB myappdb
COPY ./Schema.sql /docker-entrypoint-initdb.d/1-Schema.sql
COPY ./Masterdata.sql /docker-entrypoint-initdb.d/2-Masterdata.sql

version: "3.9"
services:
  myapp-db:
    build: ./database
    ports:
      - "5432:5432"
  myapp-pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    ports:
      - "80:80"
    environment:
      - PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com
      - PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin
    volumes:
      - pgadminvolume:/var/lib/pgadmin
volumes:
  pgadminvolume: {}

Gestartet wird wie gewohnt:

docker-compose up

Sollte es erforderlich sein, das Image neu zu bauen, zB wenn ich das Schema verändert hat:

docker-compose up --build
# or
docker-compose build

UPDATE: Das war leider nix mit dem vorgefüllten Image

Das Dockerfile enthält zwar den Schritt die SQL Dateien in das Image zu kopieren. Es fehlt aber der Schritt, bei dem diese Dateien in die Datenbank hineinmigriert werden. Das geschieht wie zuvor auch erst beim Starten des Containers. Mein Ziel, einen Image zu haben, dass diese Daten bereits enthält, habe ich damit also leider nicht erreicht. Das Dockerfile enthält keine Informationen, die nicht zuvor auch schon im Docker Compose enthalten waren.

Da mich das herumkaspern mit diesem Problem heute den ganzen Tag gekostet und abgesehen vom Erkenntnisgewinn leider nichts gebracht hat, kehre ich zur Docker Compose Variante zurück, bei der die DB beim Starten des Containers gebaut wird. Für das Beispiel auf dieser Seite macht das praktisch gesehen keinen Unterschied, da die Scripte winzig sind. Für mein Projekt leider schon, da benötigt der Aufbau der DB ein paar Minuten. Für die Anwendungsentwicklung, bei der ich die DB alle paar Tage mal neu aufsetze, ist das durchaus OK. Für Tests, die mit einer frischen DB starten sollen, die am Ende weggeschmissen wird, ist das schon ein Problem.

Also Rückkehr zu Docker Compose, diesmal mit einem extra Volume für die DB. Das kann ich dann gezielt löschen.

version: "3.9"
services:
  myapp-db:
    image: postgres:13.5-bullseye
    ports:
      - "5432:5432"
    environment:
      - POSTGRES_USER=postgres
      - POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD
      - POSTGRES_DB=myapp
    volumes:
      - postgresvolume:/var/lib/postgresql/data
      - ./database/Schema.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/1-Schema.sql
      - ./database/Masterdata.sql:/docker-entrypoint-initdb.d/2-Masterdata.sql
  myapp-pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    ports:
      - "80:80"
    environment:
      - PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com
      - PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin
    volumes:
      - pgadminvolume:/var/lib/pgadmin
volumes:
  postgresvolume: {}
  pgadminvolume: {}

Docker Befehle

# Create and start containers
docker-compose up
# Image neu bauen
docker-compose up --build
# or
docker-compose build

# Stop containers
docker-compose stop
# Start containers
docker-compose start

# Stop containers and remove them
docker-compose down
# Stop containers, remove them and remove volumes
docker-compose down -v

Tags Docker, PostgreSQL

Database Development

PostgreSQL IDs

Angenommen, wir haben eine Tabelle mit Personen:

CREATE TABLE person (
	vorname varchar(255),
    nachname varchar(255)
);

Diese Personen sollen alle eine eindeutige ID bekommen und diese soll automatisch beim Einfügen generiert werden.

Sequenz

Dazu kann man eine Sequenz anlegen und aus dieser die ID befüllen:

CREATE SEQUENCE person_id_seq
    START WITH 1
    INCREMENT BY 1
    NO MINVALUE
    NO MAXVALUE
    CACHE 1;

CREATE TABLE person (
    id integer NOT NULL DEFAULT nextval('person_id_seq'::regclass),
	vorname varchar(255),
    nachname varchar(255),
    CONSTRAINT person_pkey PRIMARY KEY (id)
);

Anschließend ein paar Personen hinzufügen:

INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Max', 'Mustermann');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Peter', 'Person');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Donald', 'Demo');

Und anzeigen lassen:

SELECT * FROM person;

Identity

Da es etwas lästig ist, immer für jede Tabelle jeweils eine eigene Sequenz anlegen und mit der ID verknüpfen zu müssen, wurde die Frage an mich herangetragen, ob es da nicht soetwas wie autoincrement gäbe, wie man es von MySQL kennen würde.

Nach kurze Recherche fand sich, dass es soetwas natürlich auch für PostgreSQL gibt und zwar seit der Version 10 als "IDENTITY".

CREATE TABLE adresse (
    id int GENERATED BY DEFAULT AS IDENTITY PRIMARY KEY,
	strasse varchar(255),
    ort varchar(255)
);

Anschließend ein paar Adressen hinzufügen:

INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Beispielstrasse', 'Beispielstadt');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Erpelweg', 'Entenhausen');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Bruchstrasse', 'Berlin');

Und anzeigen lassen:

SELECT * FROM adresse;

Der Vorteil der Identity, was man so auf den ersten Blick sieht, ist also, dass man sich etwas stumpfe Tipparbeit spart und keine Sequenz anlegen, mit der ID verknüpfen und die ID als Primary Key definieren muss.

Eine Betrachtung der Unterschiede zwischen SEQUENCE und IDENTITY habe ich leider nicht finden können.

Vermutlich gibt es da keine großen technischen Unterschiede, die IDENTITY scheint mir eine anonyme SEQUENCE zu sein.

Object ID Sequenz

Die IDENTITY kann man nur für einen TABLE nutzen, die SEQUENCE könnte man für mehrere Tabellen nutzen und so eine datenbankweite eindeutige ID verwenden.

Beispielsweise eine eindeutige Object ID Sequenz anlegen und für die Tabellen Person und Adresse verwenden:

CREATE SEQUENCE object_id_seq
    START WITH 1
    INCREMENT BY 1
    NO MINVALUE
    NO MAXVALUE
    CACHE 1;

CREATE TABLE person (
    object_id integer NOT NULL DEFAULT nextval('object_id_seq'::regclass),
	vorname varchar(255),
    nachname varchar(255),
    CONSTRAINT person_pkey PRIMARY KEY (object_id)
);

CREATE TABLE adresse (
    object_id integer NOT NULL DEFAULT nextval('object_id_seq'::regclass),
	strasse varchar(255),
    ort varchar(255),
    CONSTRAINT adresse_pkey PRIMARY KEY (object_id)
);

Anschließend ein paar Personen und Adressen hinzufügen:

INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Max', 'Mustermann');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Peter', 'Person');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Donald', 'Demo');

INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Beispielstrasse', 'Beispielstadt');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Erpelweg', 'Entenhausen');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Bruchstrasse', 'Berlin');

Und anzeigen lassen:

SELECT * FROM person;
SELECT * FROM adresse;

Wie man sehen kann, wurde die ID fortlaufend über beide Tabellen vergeben. Dadurch erhält man eine datenbankweit eindeutige, fortlaufende ID.

UUID

Und weil ich grade schon dabei bin: Seit Version 13 bringt PostgreSQL auch standartmäßig die Möglichkeit einer UUID mit.

Eine UUID ist ein Universally Unique Identifier.
Manchmal, typischerweise in Zusammenhang mit Microsoft, wird auch der Ausdruck GUID Globally Unique Identifier verwendet.

SELECT * FROM gen_random_uuid ();

UUIDs sind ebenfalls datenbankweit (und darüber hinaus) eindeutig. Allerdings sind die IDs nicht mehr fortlaufend.

UUIDs sind etwas langsamer als Sequenzen und verbrauchen etwas mehr Speicher.

Das Beispiel von vorhin:

CREATE TABLE person (
    id UUID PRIMARY KEY DEFAULT gen_random_uuid(),
	vorname varchar(255),
    nachname varchar(255)
);

CREATE TABLE adresse (
    id UUID PRIMARY KEY DEFAULT gen_random_uuid(),
	strasse varchar(255),
    ort varchar(255)
);

Anschließend ein paar Personen und Adressen hinzufügen:

INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Max', 'Mustermann');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Peter', 'Person');
INSERT INTO person (vorname, nachname) VALUES ('Donald', 'Demo');

INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Beispielstrasse', 'Beispielstadt');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Erpelweg', 'Entenhausen');
INSERT INTO adresse (strasse, ort) VALUES ('Bruchstrasse', 'Berlin');

Und anzeigen lassen:

SELECT * FROM person;
SELECT * FROM adresse;

Tags Datenbank, PostgreSQL

Database Development

PostgreSQL

Für die Neu- und Weiterentwicklung einer Anwendung habe ich zur Analyse die Bestandsanwendung samt Datenbanken bekommen.
Für die Analyse musste ich zunächst die Datenbanken zum laufen bekommen und uA mit einem DB-Client einsehen.

Ich habe zum einen eine Datei dump.backup bekommen. Zunächst musste ich herausfinden, um was für eine Datei es sich dabei handelt, dazu nutzte ich das Linux Tool file:

apt update
apt install file
file /tmp/dump.backup
# /tmp/dump.backup: PostgreSQL custom database dump - v1.14-0

Es handelt sich also um einen Dump einer PostgreSQL Datenbank. Und im Dump konnte ich eine Versionsnummer 13.0 finden.

Die andere Datei mydb.sql.gz beinhaltet eine gezippte Version eines SQL Exports einer PostgreSQL DB Version 13.2 von einem Debian 13.2 Server.

Im Laufe der weiteren Analyse der DB Exporte stellte sich heraus, dass der dump.backup die PostGIS Erweiterung der PostgreSQL DB benötigt, welche mit installiert werden muss.

PostgreSQL Datenbank Docker Image

Ich werde beide Datenbanken in einer Docker Version installieren, dazu werde ich eine DB Instanz starten, in der beide DBs installiert werden.

Die Docker Seite für Postgres: Postgres - Official Image | Docker Hub

Da es sich um die Versionsnummer 13.0 und 13.2 handelt, werde ich ein aktuelles Image von Version 13 verwenden, was zum Projektzeitpunkt Version 13.4 war.

Da zumindest eine der beiden DBs auf einem Debian System gehostet ist, werde ich ein Debian Image wählen.

Die Wahl des Images fällt also auf: postgres:13.4-buster

Datenbank installieren

Zuerst das Docker Image ziehen:

docker pull postgres:13.4-buster

Datenbank starten:

docker run --name myapp-db -p 5432:5432 -e POSTGRES_PASSWORD=PASSWORD -d postgres:13.4-buster

DB-Dateien in den laufenden Docker Container kopieren:

docker cp mydb.sql.gz myapp-db:/tmp
docker cp dump.backup myapp-db:/tmp

In den laufenden Container wechseln:

docker exec -it myapp-db bash

PostGIS installieren:

apt update
apt install -y postgresql-13-postgis-3-scripts

DB von Dump erstellen:

su postgres
createdb mydb_dump
pg_restore -d mydb_dump -v /tmp/dump.backup
exit

DB von SQL erstellen:

su postgres
cd /tmp
gunzip mydb.sql.gz
createdb mydb_sql
pg_restore -d mydb_sql -v /tmp/mydb.sql
exit

Die Datenbanken sind installiert und es kann mittels eines letzten exit der Container verlassen werden.

DB Client PGAdmin installieren

Um in die Datenbanken hinein sehen zu können wird ein Client Programm benötigt. Sicherlich es gibt da bereits etwas auf der CommandLine Ebene:

su postgres
psql mydb_sql

Übersichtlich oder komfortabel ist das aber nicht. Daher möchte ich ein Tool mit einer grafischen Oberfläche verwenden. Die Wahl fiel auf pgAdmin, welches sich leicht von einem Docker Image installieren und anschließend über den Browser bedienen lässt.

Zuerst das Docker Image ziehen:

docker pull dpage/pgadmin4

pgAdmin parametrisiert starten:

docker run --name myapp-pgadmin -p 80:80 -e PGADMIN_DEFAULT_EMAIL=admin@admin.com -e PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD=admin -d dpage/pgadmin4

Port: 80

Der pgAdmin ist über den Browser aufrufbar: http://localhost/

Für die Konfiguration für die Verbindung zur zuvor gestarteten PostgreSQL Datenbank benötige ich die IP meines Rechners, die ich mittels ipconfig herausfinden kann.

Tags Datenbank, Docker, PostgreSQL, SQL